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${ noResults }
graphkit-learn/gklearn/dataset/metadata.py

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  1. #!/usr/bin/env python3

  2. # -*- coding: utf-8 -*-

  3. """

  4. Created on Tue Oct 20 14:25:49 2020

  5. 

  6. @author: ljia

  7. """

  8. 

  9. DATABASES = {

  10. 	'greyc': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/',

  11. 	'iam': 'https://iapr-tc15.greyc.fr/IAM/',

  12. 	'tudataset': 'http://graphlearning.io/docs/datasets/',

  13. 	}

  14. 

  15. 

  16. ### -------- database greyc -------- ###

  17. GREYC_META = {

  18. 	'ACE': {

  19. 		'database': 'greyc',

  20. 		'reference': None,

  21. 		'dataset_size': 32,

  22. 		'class_number': 2,

  23. 		'task_type': 'classification',

  24. 		'ave_node_num': 52,

  25. 		'ave_edge_num': None,

  26. 		'node_labeled': None,

  27. 		'edge_labeled': None,

  28. 		'node_attr_dim': None,

  29. 		'geometry': None,

  30. 		'edge_attr_dim': None,

  31. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/ACEDataset.tar',

  32. 		'domain': 'small molecules',

  33. 		'train_valid_test': [],

  34. 		'stereoisomerism': True,

  35. 		'load_files': ['data.ds'],

  36. 	},

  37. 	'Acyclic': {

  38. 		'database': 'greyc',

  39. 		'reference': None,

  40. 		'dataset_size': 183,

  41. 		'class_number': None,

  42. 		'task_type': 'regression',

  43. 		'ave_node_num': 8.15,

  44. 		'ave_edge_num': 7.15,

  45. 		'node_labeled': True,

  46. 		'edge_labeled': False,

  47. 		'node_attr_dim': 0,

  48. 		'geometry': None,

  49. 		'edge_attr_dim': 0,

  50. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/Acyclic.tar.gz',

  51. 		'domain': 'small molecules',

  52. 		'train_valid_test': None,

  53. 		'stereoisomerism': False,

  54. 		'load_files': ['dataset_bps.ds'],

  55. 	},

  56. 	'AIDS_greyc': {

  57. 		'database': 'greyc',

  58. 		'reference': None,

  59. 		'dataset_size': 2000,

  60. 		'class_number': 2,

  61. 		'task_type': 'classification',

  62. 		'ave_node_num': 15.69,

  63. 		'ave_edge_num': 16.20,

  64. 		'node_labeled': True,

  65. 		'edge_labeled': True,

  66. 		'node_attr_dim': None,

  67. 		'geometry': None,

  68. 		'edge_attr_dim': None,

  69. 		'url': 'https://iapr-tc15.greyc.fr/IAM/AIDS.zip',

  70. 		'domain': 'small molecules',

  71. 		'train_valid_test': ['data/train.cxl', 'data/valid.cxl', 'data/test.cxl',],

  72. 		'stereoisomerism': False,

  73. 		'load_files': ['data/'],

  74. 	},

  75. 	'Alkane': {

  76. 		'database': 'greyc',

  77. 		'reference': None,

  78. 		'dataset_size': 150,

  79. 		'class_number': None,

  80. 		'task_type': 'regression',

  81. 		'ave_node_num': 8.87,

  82. 		'ave_edge_num': 7.87,

  83. 		'node_labeled': False,

  84. 		'edge_labeled': False,

  85. 		'node_attr_dim': 0,

  86. 		'geometry': None,

  87. 		'edge_attr_dim': 0,

  88. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/alkane_dataset.tar.gz',

  89. 		'domain': 'small molecules',

  90. 		'train_valid_test': None,

  91. 		'stereoisomerism': False,

  92. 		'load_files': ['dataset.ds', 'dataset_boiling_point_names.txt'],

  93. 	},

  94. 	'Chiral': {

  95. 		'database': 'greyc',

  96. 		'reference': None,

  97. 		'dataset_size': 35,

  98. 		'class_number': None,

  99. 		'task_type': 'regression',

  100. 		'ave_node_num': 21.29,

  101. 		'ave_edge_num': None,

  102. 		'node_labeled': None,

  103. 		'edge_labeled': None,

  104. 		'node_attr_dim': None,

  105. 		'geometry': None,

  106. 		'edge_attr_dim': None,

  107. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/DatasetAcyclicChiral.tar',

  108. 		'domain': 'small molecules',

  109. 		'train_valid_test': [],

  110. 		'stereoisomerism': True,

  111. 		'load_files': [],

  112. 	},

  113. 	'MAO': {

  114. 		'database': 'greyc',

  115. 		'reference': None,

  116. 		'dataset_size': 68,

  117. 		'class_number': 2,

  118. 		'task_type': 'classification',

  119. 		'ave_node_num': 18.38,

  120. 		'ave_edge_num': 19.63,

  121. 		'node_labeled': True,

  122. 		'edge_labeled': True,

  123. 		'node_attr_dim': 0,

  124. 		'geometry': None,

  125. 		'edge_attr_dim': 0,

  126. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/mao.tgz',

  127. 		'domain': 'small molecules',

  128. 		'train_valid_test': None,

  129. 		'stereoisomerism': False,

  130. 		'load_files': ['dataset.ds'],

  131. 	},

  132. 	'Monoterpenoides': {

  133. 		'database': 'greyc',

  134. 		'reference': None,

  135. 		'dataset_size': 382,

  136. 		'class_number': 10,

  137. 		'task_type': 'classification',

  138. 		'ave_node_num': 10,

  139. 		'ave_edge_num': None,

  140. 		'node_labeled': None,

  141. 		'edge_labeled': None,

  142. 		'node_attr_dim': None,

  143. 		'geometry': None,

  144. 		'edge_attr_dim': None,

  145. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/monoterpenoides.tar.gz',

  146. 		'domain': 'small molecules',

  147. 		'train_valid_test': None,

  148. 		'stereoisomerism': False,

  149. 		'load_files': ['dataset_10+.ds'],

  150. 	},

  151. 	'PAH': {

  152. 		'database': 'greyc',

  153. 		'reference': None,

  154. 		'dataset_size': 94,

  155. 		'class_number': 2,

  156. 		'task_type': 'classification',

  157. 		'ave_node_num': 20.7,

  158. 		'ave_edge_num': 24.43,

  159. 		'node_labeled': False,

  160. 		'edge_labeled': False,

  161. 		'node_attr_dim': 0,

  162. 		'geometry': None,

  163. 		'edge_attr_dim': 0,

  164. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/PAH.tar.gz',

  165. 		'domain': 'small molecules',

  166. 		'train_valid_test': ['trainset_0.ds', None, 'testset_0.ds'],

  167. 		'stereoisomerism': False,

  168. 		'load_files': ['dataset.ds'],

  169. 	},

  170. 	'PTC': {

  171. 		'database': 'greyc',

  172. 		'reference': None,

  173. 		'dataset_size': 416,

  174. 		'class_number': None,

  175. 		'task_type': 'classification',

  176. 		'ave_node_num': 14.4,

  177. 		'ave_edge_num': None,

  178. 		'node_labeled': None,

  179. 		'edge_labeled': None,

  180. 		'node_attr_dim': None,

  181. 		'geometry': None,

  182. 		'edge_attr_dim': None,

  183. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/ptc.tgz',

  184. 		'domain': 'small molecules',

  185. 		'train_valid_test': None,

  186. 		'stereoisomerism': False,

  187. 		'load_files': [],

  188. 		'extra_info': 'This dataset has test and train datasets. Select gender between mm, fm, mr, fr. \ndataloader = DataLoader(\'Ptc\',root = ..., option = \'mm\') \ntest,train = dataloader.dataset \nGs_test, y_test = test \nGs_train_, y_train = train',

  189. 	},

  190. 	'Steroid': {

  191. 		'database': 'greyc',

  192. 		'reference': None,

  193. 		'dataset_size': 64,

  194. 		'class_number': None,

  195. 		'task_type': 'regression',

  196. 		'ave_node_num': 75.11,

  197. 		'ave_edge_num': None,

  198. 		'node_labeled': None,

  199. 		'edge_labeled': None,

  200. 		'node_attr_dim': None,

  201. 		'geometry': None,

  202. 		'edge_attr_dim': None,

  203. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/SteroidDataset.tar',

  204. 		'domain': 'small molecules',

  205. 		'train_valid_test': ['trainset_0.ds', None, 'testset_0.ds'],

  206. 		'stereoisomerism': False,

  207. 		'load_files': [],

  208. 	},

  209. 	'Vitamin_D': {

  210. 		'database': 'greyc',

  211. 		'reference': None,

  212. 		'dataset_size': 69,

  213. 		'class_number': None,

  214. 		'task_type': 'regression',

  215. 		'ave_node_num': 76.91,

  216. 		'ave_edge_num': None,

  217. 		'node_labeled': None,

  218. 		'edge_labeled': None,

  219. 		'node_attr_dim': None,

  220. 		'geometry': None,

  221. 		'edge_attr_dim': None,

  222. 		'url': 'https://brunl01.users.greyc.fr/CHEMISTRY/DatasetVitamin.tar',

  223. 		'domain': 'small molecules',

  224. 		'train_valid_test': [],

  225. 		'stereoisomerism': True,

  226. 		'load_files': [],

  227. 	},

  228. }

  229. 

  230. 

  231. ### -------- database iam -------- ###

  232. # @todo: several datasets in this database are included in TUDataset. However they do not include train/valid/test sets.

  233. IAM_META = {

  234. 	'GREC': {

  235. 		'database': 'iam',

  236. 		'reference': None,

  237. 		'dataset_size': None,

  238. 		'class_number': None,

  239. 		'task_type': None,

  240. 		'ave_node_num': None,

  241. 		'ave_edge_num': None,

  242. 		'node_labeled': None,

  243. 		'edge_labeled': None,

  244. 		'node_attr_dim': None,

  245. 		'geometry': None,

  246. 		'edge_attr_dim': None,

  247. 		'url': 'https://iapr-tc15.greyc.fr/IAM/GREC.zip',

  248. 		'domain': None,

  249. 		'train_valid_test': ['data/test.cxl','data/train.cxl', 'data/valid.cxl'],

  250. 		'load_files': [],

  251. 	},

  252. 	'Web': {

  253. 		'database': 'iam',

  254. 		'reference': None,

  255. 		'dataset_size': None,

  256. 		'class_number': None,

  257. 		'task_type': None,

  258. 		'ave_node_num': None,

  259. 		'ave_edge_num': None,

  260. 		'node_labeled': None,

  261. 		'edge_labeled': None,

  262. 		'node_attr_dim': None,

  263. 		'geometry': None,

  264. 		'edge_attr_dim': None,

  265. 		'url': 'https://iapr-tc15.greyc.fr/IAM/Web.zip',

  266. 		'domain': None,

  267. 		'train_valid_test': ['data/test.cxl', 'data/train.cxl', 'data/valid.cxl'],

  268. 		'load_files': [],

  269. 	},

  270. }

  271. 

  272. 	

  273. ### -------- database tudataset -------- ###

  274. TUDataset_META = {	

  275. 	### small molecules

  276. 	'AIDS': {

  277. 		'database': 'tudataset',

  278. 		'reference': '[16,17]',

  279. 		'dataset_size': 2000,

  280. 		'class_number': 2,

  281. 		'task_type': 'classification',

  282. 		'ave_node_num': 15.69,

  283. 		'ave_edge_num': 16.2,

  284. 		'node_labeled': True,

  285. 		'edge_labeled': True,

  286. 		'node_attr_dim': 4,

  287. 		'geometry': None,

  288. 		'edge_attr_dim': 0,

  289. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/AIDS.zip',

  290. 		'domain': 'small molecules',

  291. 	},

  292. 	'alchemy_full': {

  293. 		'database': 'tudataset',

  294. 		'reference': '[29]',

  295. 		'dataset_size': 202579,

  296. 		'class_number': None,

  297. 		'task_type': 'regression',

  298. 		'ave_node_num': 10.1,

  299. 		'ave_edge_num': 10.44,

  300. 		'node_labeled': True,

  301. 		'edge_labeled': True,

  302. 		'node_attr_dim': 3,

  303. 		'geometry': '3D, RI',

  304. 		'edge_attr_dim': 0,

  305. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/alchemy_full.zip',

  306. 		'domain': 'small molecules',

  307. 	},

  308. 	'aspirin': {

  309. 		'database': 'tudataset',

  310. 		'reference': '[36]',

  311. 		'dataset_size': 111763,

  312. 		'class_number': None,

  313. 		'task_type': 'regression',

  314. 		'ave_node_num': 21.0,

  315. 		'ave_edge_num': 151.52,

  316. 		'node_labeled': True,

  317. 		'edge_labeled': False,

  318. 		'node_attr_dim': 6,

  319. 		'geometry': '3D, RI',

  320. 		'edge_attr_dim': 0,

  321. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/aspirin.zip',

  322. 		'domain': 'small molecules',

  323. 	},

  324. 	'benzene': {

  325. 		'database': 'tudataset',

  326. 		'reference': '[36]',

  327. 		'dataset_size': 527984,

  328. 		'class_number': None,

  329. 		'task_type': 'regression',

  330. 		'ave_node_num': 12.0,

  331. 		'ave_edge_num': 64.94,

  332. 		'node_labeled': True,

  333. 		'edge_labeled': False,

  334. 		'node_attr_dim': 6,

  335. 		'geometry': '3D, RI',

  336. 		'edge_attr_dim': 0,

  337. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/benzene.zip',

  338. 		'domain': 'small molecules',

  339. 	},

  340. 	'BZR': {

  341. 		'database': 'tudataset',

  342. 		'reference': '[7]',

  343. 		'dataset_size': 405,

  344. 		'class_number': 2,

  345. 		'task_type': 'classification',

  346. 		'ave_node_num': 35.75,

  347. 		'ave_edge_num': 38.36,

  348. 		'node_labeled': True,

  349. 		'edge_labeled': False,

  350. 		'node_attr_dim': 3,

  351. 		'geometry': '3D, RI',

  352. 		'edge_attr_dim': 0,

  353. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/BZR.zip',

  354. 		'domain': 'small molecules',

  355. 	},

  356. 	'BZR_MD': {

  357. 		'database': 'tudataset',

  358. 		'reference': '[7,23]',

  359. 		'dataset_size': 306,

  360. 		'class_number': 2,

  361. 		'task_type': 'classification',

  362. 		'ave_node_num': 21.3,

  363. 		'ave_edge_num': 225.06,

  364. 		'node_labeled': True,

  365. 		'edge_labeled': True,

  366. 		'node_attr_dim': 0,

  367. 		'geometry': None,

  368. 		'edge_attr_dim': 1,

  369. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/BZR_MD.zip',

  370. 		'domain': 'small molecules',

  371. 	},

  372. 	'COX2': {

  373. 		'database': 'tudataset',

  374. 		'reference': '[7]',

  375. 		'dataset_size': 467,

  376. 		'class_number': 2,

  377. 		'task_type': 'classification',

  378. 		'ave_node_num': 41.22,

  379. 		'ave_edge_num': 43.45,

  380. 		'node_labeled': True,

  381. 		'edge_labeled': False,

  382. 		'node_attr_dim': 3,

  383. 		'geometry': '3D, RI',

  384. 		'edge_attr_dim': 0,

  385. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/COX2.zip',

  386. 		'domain': 'small molecules',

  387. 	},

  388. 	'COX2_MD': {

  389. 		'database': 'tudataset',

  390. 		'reference': '[7,23]',

  391. 		'dataset_size': 303,

  392. 		'class_number': 2,

  393. 		'task_type': 'classification',

  394. 		'ave_node_num': 26.28,

  395. 		'ave_edge_num': 335.12,

  396. 		'node_labeled': True,

  397. 		'edge_labeled': True,

  398. 		'node_attr_dim': 0,

  399. 		'geometry': None,

  400. 		'edge_attr_dim': 1,

  401. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/COX2_MD.zip',

  402. 		'domain': 'small molecules',

  403. 	},

  404. 	'DHFR': {

  405. 		'database': 'tudataset',

  406. 		'reference': '[7]',

  407. 		'dataset_size': 467,

  408. 		'class_number': 2,

  409. 		'task_type': 'classification',

  410. 		'ave_node_num': 42.43,

  411. 		'ave_edge_num': 44.54,

  412. 		'node_labeled': True,

  413. 		'edge_labeled': False,

  414. 		'node_attr_dim': 3,

  415. 		'geometry': '3D, RI',

  416. 		'edge_attr_dim': 0,

  417. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/DHFR.zip',

  418. 		'domain': 'small molecules',

  419. 	},

  420. 	'DHFR_MD': {

  421. 		'database': 'tudataset',

  422. 		'reference': '[7,23]',

  423. 		'dataset_size': 393,

  424. 		'class_number': 2,

  425. 		'task_type': 'classification',

  426. 		'ave_node_num': 23.87,

  427. 		'ave_edge_num': 283.01,

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  431. 		'geometry': None,

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  433. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/DHFR_MD.zip',

  434. 		'domain': 'small molecules',

  435. 	},

  436. 	'ER_MD': {

  437. 		'database': 'tudataset',

  438. 		'reference': '[7,23]',

  439. 		'dataset_size': 446,

  440. 		'class_number': 2,

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  449. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/ER_MD.zip',

  450. 		'domain': 'small molecules',

  451. 	},

  452. 	'ethanol': {

  453. 		'database': 'tudataset',

  454. 		'reference': '[36]',

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  456. 		'class_number': None,

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  468. 	'FRANKENSTEIN': {

  469. 		'database': 'tudataset',

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  482. 		'domain': 'small molecules',

  483. 	},

  484. 	'malonaldehyde': {

  485. 		'database': 'tudataset',

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  498. 		'domain': 'small molecules',

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  500. 	'MCF-7': {

  501. 		'database': 'tudataset',

  502. 		'reference': '[28]',

  503. 		'dataset_size': 27770,

  504. 		'class_number': 2,

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  513. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/MCF-7.zip',

  514. 		'domain': 'small molecules',

  515. 	},

  516. 	'MCF-7H': {

  517. 		'database': 'tudataset',

  518. 		'reference': '[28]',

  519. 		'dataset_size': 27770,

  520. 		'class_number': 2,

  521. 		'task_type': 'classification',

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  529. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/MCF-7H.zip',

  530. 		'domain': 'small molecules',

  531. 	},

  532. 	'MOLT-4': {

  533. 		'database': 'tudataset',

  534. 		'reference': '[28]',

  535. 		'dataset_size': 39765,

  536. 		'class_number': 2,

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  540. 		'node_labeled': True,

  541. 		'edge_labeled': True,

  542. 		'node_attr_dim': 0,

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  546. 		'domain': 'small molecules',

  547. 	},

  548. 	'MOLT-4H': {

  549. 		'database': 'tudataset',

  550. 		'reference': '[28]',

  551. 		'dataset_size': 39765,

  552. 		'class_number': 2,

  553. 		'task_type': 'classification',

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  559. 		'geometry': None,

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  561. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/MOLT-4H.zip',

  562. 		'domain': 'small molecules',

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  564. 	'Mutagenicity': {

  565. 		'database': 'tudataset',

  566. 		'reference': '[16,20]',

  567. 		'dataset_size': 4337,

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  574. 		'node_attr_dim': 0,

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  577. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Mutagenicity.zip',

  578. 		'domain': 'small molecules',

  579. 	},

  580. 	'MUTAG': {

  581. 		'database': 'tudataset',

  582. 		'reference': '[1,23]',

  583. 		'dataset_size': 188,

  584. 		'class_number': 2,

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  588. 		'node_labeled': True,

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  590. 		'node_attr_dim': 0,

  591. 		'geometry': None,

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  594. 		'domain': 'small molecules',

  595. 	},

  596. 	'naphthalene': {

  597. 		'database': 'tudataset',

  598. 		'reference': '[36]',

  599. 		'dataset_size': 226256,

  600. 		'class_number': None,

  601. 		'task_type': 'regression',

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  603. 		'ave_edge_num': 127.37,

  604. 		'node_labeled': True,

  605. 		'edge_labeled': False,

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  607. 		'geometry': '3D, RI',

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  610. 		'domain': 'small molecules',

  611. 	},

  612. 	'NCI1': {

  613. 		'database': 'tudataset',

  614. 		'reference': '[8,9,22]',

  615. 		'dataset_size': 4110,

  616. 		'class_number': 2,

  617. 		'task_type': 'classification',

  618. 		'ave_node_num': 29.87,

  619. 		'ave_edge_num': 32.3,

  620. 		'node_labeled': True,

  621. 		'edge_labeled': False,

  622. 		'node_attr_dim': 0,

  623. 		'geometry': None,

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  625. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/NCI1.zip',

  626. 		'domain': 'small molecules',

  627. 	},

  628. 	'NCI109': {

  629. 		'database': 'tudataset',

  630. 		'reference': '[8,9,22]',

  631. 		'dataset_size': 4127,

  632. 		'class_number': 2,

  633. 		'task_type': 'classification',

  634. 		'ave_node_num': 29.68,

  635. 		'ave_edge_num': 32.13,

  636. 		'node_labeled': True,

  637. 		'edge_labeled': False,

  638. 		'node_attr_dim': 0,

  639. 		'geometry': None,

  640. 		'edge_attr_dim': 0,

  641. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/NCI109.zip',

  642. 		'domain': 'small molecules',

  643. 	},

  644. 	'NCI-H23': {

  645. 		'database': 'tudataset',

  646. 		'reference': '[28]',

  647. 		'dataset_size': 40353,

  648. 		'class_number': 2,

  649. 		'task_type': 'classification',

  650. 		'ave_node_num': 26.07,

  651. 		'ave_edge_num': 28.1,

  652. 		'node_labeled': True,

  653. 		'edge_labeled': True,

  654. 		'node_attr_dim': 0,

  655. 		'geometry': None,

  656. 		'edge_attr_dim': 0,

  657. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/NCI-H23.zip',

  658. 		'domain': 'small molecules',

  659. 	},

  660. 	'NCI-H23H': {

  661. 		'database': 'tudataset',

  662. 		'reference': '[28]',

  663. 		'dataset_size': 40353,

  664. 		'class_number': 2,

  665. 		'task_type': 'classification',

  666. 		'ave_node_num': 46.67,

  667. 		'ave_edge_num': 48.69,

  668. 		'node_labeled': True,

  669. 		'edge_labeled': True,

  670. 		'node_attr_dim': 0,

  671. 		'geometry': None,

  672. 		'edge_attr_dim': 0,

  673. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/NCI-H23H.zip',

  674. 		'domain': 'small molecules',

  675. 	},

  676. 	'OVCAR-8': {

  677. 		'database': 'tudataset',

  678. 		'reference': '[28]',

  679. 		'dataset_size': 40516,

  680. 		'class_number': 2,

  681. 		'task_type': 'classification',

  682. 		'ave_node_num': 26.07,

  683. 		'ave_edge_num': 28.1,

  684. 		'node_labeled': True,

  685. 		'edge_labeled': True,

  686. 		'node_attr_dim': 0,

  687. 		'geometry': None,

  688. 		'edge_attr_dim': 0,

  689. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/OVCAR-8.zip',

  690. 		'domain': 'small molecules',

  691. 	},

  692. 	'OVCAR-8H': {

  693. 		'database': 'tudataset',

  694. 		'reference': '[28]',

  695. 		'dataset_size': 40516,

  696. 		'class_number': 2,

  697. 		'task_type': 'classification',

  698. 		'ave_node_num': 46.67,

  699. 		'ave_edge_num': 48.7,

  700. 		'node_labeled': True,

  701. 		'edge_labeled': True,

  702. 		'node_attr_dim': 0,

  703. 		'geometry': None,

  704. 		'edge_attr_dim': 0,

  705. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/OVCAR-8H.zip',

  706. 		'domain': 'small molecules',

  707. 	},

  708. 	'P388': {

  709. 		'database': 'tudataset',

  710. 		'reference': '[28]',

  711. 		'dataset_size': 41472,

  712. 		'class_number': 2,

  713. 		'task_type': 'classification',

  714. 		'ave_node_num': 22.11,

  715. 		'ave_edge_num': 23.55,

  716. 		'node_labeled': True,

  717. 		'edge_labeled': True,

  718. 		'node_attr_dim': 0,

  719. 		'geometry': None,

  720. 		'edge_attr_dim': 0,

  721. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/P388.zip',

  722. 		'domain': 'small molecules',

  723. 	},

  724. 	'P388H': {

  725. 		'database': 'tudataset',

  726. 		'reference': '[28]',

  727. 		'dataset_size': 41472,

  728. 		'class_number': 2,

  729. 		'task_type': 'classification',

  730. 		'ave_node_num': 40.44,

  731. 		'ave_edge_num': 41.88,

  732. 		'node_labeled': True,

  733. 		'edge_labeled': True,

  734. 		'node_attr_dim': 0,

  735. 		'geometry': None,

  736. 		'edge_attr_dim': 0,

  737. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/P388H.zip',

  738. 		'domain': 'small molecules',

  739. 	},

  740. 	'PC-3': {

  741. 		'database': 'tudataset',

  742. 		'reference': '[28]',

  743. 		'dataset_size': 27509,

  744. 		'class_number': 2,

  745. 		'task_type': 'classification',

  746. 		'ave_node_num': 26.35,

  747. 		'ave_edge_num': 28.49,

  748. 		'node_labeled': True,

  749. 		'edge_labeled': True,

  750. 		'node_attr_dim': 0,

  751. 		'geometry': None,

  752. 		'edge_attr_dim': 0,

  753. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PC-3.zip',

  754. 		'domain': 'small molecules',

  755. 	},

  756. 	'PC-3H': {

  757. 		'database': 'tudataset',

  758. 		'reference': '[28]',

  759. 		'dataset_size': 27509,

  760. 		'class_number': 2,

  761. 		'task_type': 'classification',

  762. 		'ave_node_num': 47.19,

  763. 		'ave_edge_num': 49.32,

  764. 		'node_labeled': True,

  765. 		'edge_labeled': True,

  766. 		'node_attr_dim': 0,

  767. 		'geometry': None,

  768. 		'edge_attr_dim': 0,

  769. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PC-3H.zip',

  770. 		'domain': 'small molecules',

  771. 	},

  772. 	'PTC_FM': {

  773. 		'database': 'tudataset',

  774. 		'reference': '[2,23]',

  775. 		'dataset_size': 349,

  776. 		'class_number': 2,

  777. 		'task_type': 'classification',

  778. 		'ave_node_num': 14.11,

  779. 		'ave_edge_num': 14.48,

  780. 		'node_labeled': True,

  781. 		'edge_labeled': True,

  782. 		'node_attr_dim': 0,

  783. 		'geometry': None,

  784. 		'edge_attr_dim': 0,

  785. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PTC_FM.zip',

  786. 		'domain': 'small molecules',

  787. 	},

  788. 	'PTC_FR': {

  789. 		'database': 'tudataset',

  790. 		'reference': '[2,23]',

  791. 		'dataset_size': 351,

  792. 		'class_number': 2,

  793. 		'task_type': 'classification',

  794. 		'ave_node_num': 14.56,

  795. 		'ave_edge_num': 15.0,

  796. 		'node_labeled': True,

  797. 		'edge_labeled': True,

  798. 		'node_attr_dim': 0,

  799. 		'geometry': None,

  800. 		'edge_attr_dim': 0,

  801. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PTC_FR.zip',

  802. 		'domain': 'small molecules',

  803. 	},

  804. 	'PTC_MM': {

  805. 		'database': 'tudataset',

  806. 		'reference': '[2,23]',

  807. 		'dataset_size': 336,

  808. 		'class_number': 2,

  809. 		'task_type': 'classification',

  810. 		'ave_node_num': 13.97,

  811. 		'ave_edge_num': 14.32,

  812. 		'node_labeled': True,

  813. 		'edge_labeled': True,

  814. 		'node_attr_dim': 0,

  815. 		'geometry': None,

  816. 		'edge_attr_dim': 0,

  817. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PTC_MM.zip',

  818. 		'domain': 'small molecules',

  819. 	},

  820. 	'PTC_MR': {

  821. 		'database': 'tudataset',

  822. 		'reference': '[2,23]',

  823. 		'dataset_size': 344,

  824. 		'class_number': 2,

  825. 		'task_type': 'classification',

  826. 		'ave_node_num': 14.29,

  827. 		'ave_edge_num': 14.69,

  828. 		'node_labeled': True,

  829. 		'edge_labeled': True,

  830. 		'node_attr_dim': 0,

  831. 		'geometry': None,

  832. 		'edge_attr_dim': 0,

  833. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PTC_MR.zip',

  834. 		'domain': 'small molecules',

  835. 	},

  836. 	'QM9': {

  837. 		'database': 'tudataset',

  838. 		'reference': '[33,34,35]',

  839. 		'dataset_size': 129433,

  840. 		'class_number': None,

  841. 		'task_type': 'regression',

  842. 		'ave_node_num': 18.03,

  843. 		'ave_edge_num': 18.63,

  844. 		'node_labeled': False,

  845. 		'edge_labeled': False,

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  1122. 		'domain': 'small molecules',

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  1124. 	'Tox21_ARE_training': {

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  1188. 	'Tox21_aromatase_testing': {

  1189. 		'database': 'tudataset',

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  1204. 	'Tox21_aromatase_evaluation': {

  1205. 		'database': 'tudataset',

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  1236. 	'Tox21_ATAD5_testing': {

  1237. 		'database': 'tudataset',

  1238. 		'reference': '[24]',

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  1364. 	'Tox21_HSE_training': {

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  1380. 	'Tox21_HSE_testing': {

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  1412. 	'Tox21_MMP_training': {

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  1428. 	'Tox21_MMP_testing': {

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  1444. 	'Tox21_MMP_evaluation': {

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  1460. 	'Tox21_p53_training': {

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  1476. 	'Tox21_p53_testing': {

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  1492. 	'Tox21_p53_evaluation': {

  1493. 		'database': 'tudataset',

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  1500. 		'node_labeled': True,

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  1506. 		'domain': 'small molecules',

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  1508. 	'Tox21_PPAR-gamma_training': {

  1509. 		'database': 'tudataset',

  1510. 		'reference': '[24]',

  1511. 		'dataset_size': 8184,

  1512. 		'class_number': 2,

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  1521. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Tox21_PPAR-gamma_training.zip',

  1522. 		'domain': 'small molecules',

  1523. 	},

  1524. 	'Tox21_PPAR-gamma_testing': {

  1525. 		'database': 'tudataset',

  1526. 		'reference': '[24]',

  1527. 		'dataset_size': 267,

  1528. 		'class_number': 2,

  1529. 		'task_type': 'classification',

  1530. 		'ave_node_num': 22.04,

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  1539. 	},

  1540. 	'Tox21_PPAR-gamma_evaluation': {

  1541. 		'database': 'tudataset',

  1542. 		'reference': '[24]',

  1543. 		'dataset_size': 602,

  1544. 		'class_number': 2,

  1545. 		'task_type': 'classification',

  1546. 		'ave_node_num': 17.38,

  1547. 		'ave_edge_num': 17.77,

  1548. 		'node_labeled': True,

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  1550. 		'node_attr_dim': 0,

  1551. 		'geometry': None,

  1552. 		'edge_attr_dim': 0,

  1553. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Tox21_PPAR-gamma_evaluation.zip',

  1554. 		'domain': 'small molecules',

  1555. 	},

  1556. 	'UACC257': {

  1557. 		'database': 'tudataset',

  1558. 		'reference': '[28]',

  1559. 		'dataset_size': 39988,

  1560. 		'class_number': 2,

  1561. 		'task_type': 'classification',

  1562. 		'ave_node_num': 26.09,

  1563. 		'ave_edge_num': 28.12,

  1564. 		'node_labeled': True,

  1565. 		'edge_labeled': True,

  1566. 		'node_attr_dim': 0,

  1567. 		'geometry': None,

  1568. 		'edge_attr_dim': 0,

  1569. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/UACC257.zip',

  1570. 		'domain': 'small molecules',

  1571. 	},

  1572. 	'UACC257H': {

  1573. 		'database': 'tudataset',

  1574. 		'reference': '[28]',

  1575. 		'dataset_size': 39988,

  1576. 		'class_number': 2,

  1577. 		'task_type': 'classification',

  1578. 		'ave_node_num': 46.68,

  1579. 		'ave_edge_num': 48.71,

  1580. 		'node_labeled': True,

  1581. 		'edge_labeled': True,

  1582. 		'node_attr_dim': 0,

  1583. 		'geometry': None,

  1584. 		'edge_attr_dim': 0,

  1585. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/UACC257H.zip',

  1586. 		'domain': 'small molecules',

  1587. 	},

  1588. 	'uracil': {

  1589. 		'database': 'tudataset',

  1590. 		'reference': '[36]',

  1591. 		'dataset_size': 133770,

  1592. 		'class_number': None,

  1593. 		'task_type': 'regression',

  1594. 		'ave_node_num': 12.0,

  1595. 		'ave_edge_num': 64.44,

  1596. 		'node_labeled': True,

  1597. 		'edge_labeled': False,

  1598. 		'node_attr_dim': 6,

  1599. 		'geometry': '3D, RI',

  1600. 		'edge_attr_dim': 0,

  1601. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/uracil.zip',

  1602. 		'domain': 'small molecules',

  1603. 	},

  1604. 	'Yeast': {

  1605. 		'database': 'tudataset',

  1606. 		'reference': '[28]',

  1607. 		'dataset_size': 79601,

  1608. 		'class_number': 2,

  1609. 		'task_type': 'classification',

  1610. 		'ave_node_num': 21.54,

  1611. 		'ave_edge_num': 22.84,

  1612. 		'node_labeled': True,

  1613. 		'edge_labeled': True,

  1614. 		'node_attr_dim': 0,

  1615. 		'geometry': None,

  1616. 		'edge_attr_dim': 0,

  1617. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Yeast.zip',

  1618. 		'domain': 'small molecules',

  1619. 	},

  1620. 	'YeastH': {

  1621. 		'database': 'tudataset',

  1622. 		'reference': '[28]',

  1623. 		'dataset_size': 79601,

  1624. 		'class_number': 2,

  1625. 		'task_type': 'classification',

  1626. 		'ave_node_num': 39.44,

  1627. 		'ave_edge_num': 40.74,

  1628. 		'node_labeled': True,

  1629. 		'edge_labeled': True,

  1630. 		'node_attr_dim': 0,

  1631. 		'geometry': None,

  1632. 		'edge_attr_dim': 0,

  1633. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/YeastH.zip',

  1634. 		'domain': 'small molecules',

  1635. 	},

  1636. 	'ZINC_full': {

  1637. 		'database': 'tudataset',

  1638. 		'reference': '[31]',

  1639. 		'dataset_size': 249456,

  1640. 		'class_number': None,

  1641. 		'task_type': 'regression',

  1642. 		'ave_node_num': 23.14,

  1643. 		'ave_edge_num': 24.91,

  1644. 		'node_labeled': True,

  1645. 		'edge_labeled': True,

  1646. 		'node_attr_dim': 0,

  1647. 		'geometry': None,

  1648. 		'edge_attr_dim': 0,

  1649. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/ZINC_full.zip',

  1650. 		'domain': 'small molecules',

  1651. 	},

  1652. 	'ZINC_test': {

  1653. 		'database': 'tudataset',

  1654. 		'reference': '[31]',

  1655. 		'dataset_size': 5000,

  1656. 		'class_number': None,

  1657. 		'task_type': 'regression',

  1658. 		'ave_node_num': 23.1,

  1659. 		'ave_edge_num': 24.83,

  1660. 		'node_labeled': True,

  1661. 		'edge_labeled': True,

  1662. 		'node_attr_dim': 0,

  1663. 		'geometry': None,

  1664. 		'edge_attr_dim': 0,

  1665. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/ZINC_test.zip',

  1666. 		'domain': 'small molecules',

  1667. 	},

  1668. 	'ZINC_train': {

  1669. 		'database': 'tudataset',

  1670. 		'reference': '[31]',

  1671. 		'dataset_size': 220011,

  1672. 		'class_number': None,

  1673. 		'task_type': 'regression',

  1674. 		'ave_node_num': 23.15,

  1675. 		'ave_edge_num': 24.91,

  1676. 		'node_labeled': True,

  1677. 		'edge_labeled': True,

  1678. 		'node_attr_dim': 0,

  1679. 		'geometry': None,

  1680. 		'edge_attr_dim': 0,

  1681. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/ZINC_train.zip',

  1682. 		'domain': 'small molecules',

  1683. 	},

  1684. 	'ZINC_val': {

  1685. 		'database': 'tudataset',

  1686. 		'reference': '[31]',

  1687. 		'dataset_size': 24445,

  1688. 		'class_number': None,

  1689. 		'task_type': 'regression',

  1690. 		'ave_node_num': 23.13,

  1691. 		'ave_edge_num': 24.88,

  1692. 		'node_labeled': True,

  1693. 		'edge_labeled': True,

  1694. 		'node_attr_dim': 0,

  1695. 		'geometry': None,

  1696. 		'edge_attr_dim': 0,

  1697. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/ZINC_val.zip',

  1698. 		'domain': 'small molecules',

  1699. 	},

  1700. 	

  1701. 	### bioinformatics

  1702. 	'DD': {

  1703. 		'database': 'tudataset',

  1704. 		'reference': '[6,22]',

  1705. 		'dataset_size': 1178,

  1706. 		'class_number': 2,

  1707. 		'task_type': 'classification',

  1708. 		'ave_node_num': 284.32,

  1709. 		'ave_edge_num': 715.66,

  1710. 		'node_labeled': True,

  1711. 		'edge_labeled': False,

  1712. 		'node_attr_dim': 0,

  1713. 		'geometry': None,

  1714. 		'edge_attr_dim': 0,

  1715. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/DD.zip',

  1716. 		'domain': 'bioinformatics',

  1717. 	},

  1718. 	'ENZYMES': {

  1719. 		'database': 'tudataset',

  1720. 		'reference': '[4,5]',

  1721. 		'dataset_size': 600,

  1722. 		'class_number': 6,

  1723. 		'task_type': 'classification',

  1724. 		'ave_node_num': 32.63,

  1725. 		'ave_edge_num': 62.14,

  1726. 		'node_labeled': True,

  1727. 		'edge_labeled': False,

  1728. 		'node_attr_dim': 18,

  1729. 		'geometry': None,

  1730. 		'edge_attr_dim': 0,

  1731. 		'url': 'http://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/ENZYMES.zip',

  1732. 		'domain': 'bioinformatics',

  1733. 	},

  1734. 	'KKI': {

  1735. 		'database': 'tudataset',

  1736. 		'reference': '[26]',

  1737. 		'dataset_size': 83,

  1738. 		'class_number': 2,

  1739. 		'task_type': 'classification',

  1740. 		'ave_node_num': 26.96,

  1741. 		'ave_edge_num': 48.42,

  1742. 		'node_labeled': True,

  1743. 		'edge_labeled': False,

  1744. 		'node_attr_dim': 0,

  1745. 		'geometry': None,

  1746. 		'edge_attr_dim': 0,

  1747. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/KKI.zip',

  1748. 		'domain': 'bioinformatics',

  1749. 	},

  1750. 	'OHSU': {

  1751. 		'database': 'tudataset',

  1752. 		'reference': '[26]',

  1753. 		'dataset_size': 79,

  1754. 		'class_number': 2,

  1755. 		'task_type': 'classification',

  1756. 		'ave_node_num': 82.01,

  1757. 		'ave_edge_num': 199.66,

  1758. 		'node_labeled': True,

  1759. 		'edge_labeled': False,

  1760. 		'node_attr_dim': 0,

  1761. 		'geometry': None,

  1762. 		'edge_attr_dim': 0,

  1763. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/OHSU.zip',

  1764. 		'domain': 'bioinformatics',

  1765. 	},

  1766. 	'Peking_1': {

  1767. 		'database': 'tudataset',

  1768. 		'reference': '[26]',

  1769. 		'dataset_size': 85,

  1770. 		'class_number': 2,

  1771. 		'task_type': 'classification',

  1772. 		'ave_node_num': 39.31,

  1773. 		'ave_edge_num': 77.35,

  1774. 		'node_labeled': True,

  1775. 		'edge_labeled': False,

  1776. 		'node_attr_dim': 0,

  1777. 		'geometry': None,

  1778. 		'edge_attr_dim': 0,

  1779. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Peking_1.zip',

  1780. 		'domain': 'bioinformatics',

  1781. 	},

  1782. 	'PROTEINS': {

  1783. 		'database': 'tudataset',

  1784. 		'reference': '[4,6]',

  1785. 		'dataset_size': 1113,

  1786. 		'class_number': 2,

  1787. 		'task_type': 'classification',

  1788. 		'ave_node_num': 39.06,

  1789. 		'ave_edge_num': 72.82,

  1790. 		'node_labeled': True,

  1791. 		'edge_labeled': False,

  1792. 		'node_attr_dim': 1,

  1793. 		'geometry': None,

  1794. 		'edge_attr_dim': 0,

  1795. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PROTEINS.zip',

  1796. 		'domain': 'bioinformatics',

  1797. 	},

  1798. 	'PROTEINS_full': {

  1799. 		'database': 'tudataset',

  1800. 		'reference': '[4,6]',

  1801. 		'dataset_size': 1113,

  1802. 		'class_number': 2,

  1803. 		'task_type': 'classification',

  1804. 		'ave_node_num': 39.06,

  1805. 		'ave_edge_num': 72.82,

  1806. 		'node_labeled': True,

  1807. 		'edge_labeled': False,

  1808. 		'node_attr_dim': 29,

  1809. 		'geometry': None,

  1810. 		'edge_attr_dim': 0,

  1811. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/PROTEINS_full.zip',

  1812. 		'domain': 'bioinformatics',

  1813. 	},

  1814. 	

  1815. 	### computer vision

  1816. 	'COIL-DEL': {

  1817. 		'database': 'tudataset',

  1818. 		'reference': '[16,18]',

  1819. 		'dataset_size': 3900,

  1820. 		'class_number': 100,

  1821. 		'task_type': 'classification',

  1822. 		'ave_node_num': 21.54,

  1823. 		'ave_edge_num': 54.24,

  1824. 		'node_labeled': False,

  1825. 		'edge_labeled': True,

  1826. 		'node_attr_dim': 2,

  1827. 		'geometry': None,

  1828. 		'edge_attr_dim': 0,

  1829. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/COIL-DEL.zip',

  1830. 		'domain': 'computer vision',

  1831. 	},

  1832. 	'COIL-RAG': {

  1833. 		'database': 'tudataset',

  1834. 		'reference': '[16,18]',

  1835. 		'dataset_size': 3900,

  1836. 		'class_number': 100,

  1837. 		'task_type': 'classification',

  1838. 		'ave_node_num': 3.01,

  1839. 		'ave_edge_num': 3.02,

  1840. 		'node_labeled': False,

  1841. 		'edge_labeled': False,

  1842. 		'node_attr_dim': 64,

  1843. 		'geometry': None,

  1844. 		'edge_attr_dim': 1,

  1845. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/COIL-RAG.zip',

  1846. 		'domain': 'computer vision',

  1847. 	},

  1848. 	'Cuneiform': {

  1849. 		'database': 'tudataset',

  1850. 		'reference': '[25]',

  1851. 		'dataset_size': 267,

  1852. 		'class_number': 30,

  1853. 		'task_type': 'classification',

  1854. 		'ave_node_num': 21.27,

  1855. 		'ave_edge_num': 44.8,

  1856. 		'node_labeled': True,

  1857. 		'edge_labeled': True,

  1858. 		'node_attr_dim': 3,

  1859. 		'geometry': '3D',

  1860. 		'edge_attr_dim': 2,

  1861. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Cuneiform.zip',

  1862. 		'domain': 'computer vision',

  1863. 	},

  1864. 	'Fingerprint': {

  1865. 		'database': 'tudataset',

  1866. 		'reference': '[16,19]',

  1867. 		'dataset_size': 2800,

  1868. 		'class_number': 4,

  1869. 		'task_type': 'classification',

  1870. 		'ave_node_num': 5.42,

  1871. 		'ave_edge_num': 4.42,

  1872. 		'node_labeled': False,

  1873. 		'edge_labeled': False,

  1874. 		'node_attr_dim': 2,

  1875. 		'geometry': '2D',

  1876. 		'edge_attr_dim': 2,

  1877. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Fingerprint.zip',

  1878. 		'domain': 'computer vision',

  1879. 	},

  1880. 	'FIRSTMM_DB': {

  1881. 		'database': 'tudataset',

  1882. 		'reference': '[11,12,13]',

  1883. 		'dataset_size': 41,

  1884. 		'class_number': 11,

  1885. 		'task_type': 'classification',

  1886. 		'ave_node_num': 1377.27,

  1887. 		'ave_edge_num': 3074.1,

  1888. 		'node_labeled': True,

  1889. 		'edge_labeled': False,

  1890. 		'node_attr_dim': 1,

  1891. 		'geometry': None,

  1892. 		'edge_attr_dim': 2,

  1893. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/FIRSTMM_DB.zip',

  1894. 		'domain': 'computer vision',

  1895. 	},

  1896. 	'Letter-high': {

  1897. 		'database': 'tudataset',

  1898. 		'reference': '[16]',

  1899. 		'dataset_size': 2250,

  1900. 		'class_number': 15,

  1901. 		'task_type': 'classification',

  1902. 		'ave_node_num': 4.67,

  1903. 		'ave_edge_num': 4.5,

  1904. 		'node_labeled': False,

  1905. 		'edge_labeled': False,

  1906. 		'node_attr_dim': 2,

  1907. 		'geometry': '2D',

  1908. 		'edge_attr_dim': 0,

  1909. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Letter-high.zip',

  1910. 		'domain': 'computer vision',

  1911. 	},

  1912. 	'Letter-low': {

  1913. 		'database': 'tudataset',

  1914. 		'reference': '[16]',

  1915. 		'dataset_size': 2250,

  1916. 		'class_number': 15,

  1917. 		'task_type': 'classification',

  1918. 		'ave_node_num': 4.68,

  1919. 		'ave_edge_num': 3.13,

  1920. 		'node_labeled': False,

  1921. 		'edge_labeled': False,

  1922. 		'node_attr_dim': 2,

  1923. 		'geometry': '2D',

  1924. 		'edge_attr_dim': 0,

  1925. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Letter-low.zip',

  1926. 		'domain': 'computer vision',

  1927. 	},

  1928. 	'Letter-med': {

  1929. 		'database': 'tudataset',

  1930. 		'reference': '[16]',

  1931. 		'dataset_size': 2250,

  1932. 		'class_number': 15,

  1933. 		'task_type': 'classification',

  1934. 		'ave_node_num': 4.67,

  1935. 		'ave_edge_num': 4.5,

  1936. 		'node_labeled': False,

  1937. 		'edge_labeled': False,

  1938. 		'node_attr_dim': 2,

  1939. 		'geometry': '2D',

  1940. 		'edge_attr_dim': 0,

  1941. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Letter-med.zip',

  1942. 		'domain': 'computer vision',

  1943. 	},

  1944. 	'MSRC_9': {

  1945. 		'database': 'tudataset',

  1946. 		'reference': '[13]',

  1947. 		'dataset_size': 221,

  1948. 		'class_number': 8,

  1949. 		'task_type': 'classification',

  1950. 		'ave_node_num': 40.58,

  1951. 		'ave_edge_num': 97.94,

  1952. 		'node_labeled': True,

  1953. 		'edge_labeled': False,

  1954. 		'node_attr_dim': 0,

  1955. 		'geometry': None,

  1956. 		'edge_attr_dim': 0,

  1957. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/MSRC_9.zip',

  1958. 		'domain': 'computer vision',

  1959. 	},

  1960. 	'MSRC_21': {

  1961. 		'database': 'tudataset',

  1962. 		'reference': '[13]',

  1963. 		'dataset_size': 563,

  1964. 		'class_number': 20,

  1965. 		'task_type': 'classification',

  1966. 		'ave_node_num': 77.52,

  1967. 		'ave_edge_num': 198.32,

  1968. 		'node_labeled': True,

  1969. 		'edge_labeled': False,

  1970. 		'node_attr_dim': 0,

  1971. 		'geometry': None,

  1972. 		'edge_attr_dim': 0,

  1973. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/MSRC_21.zip',

  1974. 		'domain': 'computer vision',

  1975. 	},

  1976. 	'MSRC_21C': {

  1977. 		'database': 'tudataset',

  1978. 		'reference': '[13]',

  1979. 		'dataset_size': 209,

  1980. 		'class_number': 20,

  1981. 		'task_type': 'classification',

  1982. 		'ave_node_num': 40.28,

  1983. 		'ave_edge_num': 96.6,

  1984. 		'node_labeled': True,

  1985. 		'edge_labeled': False,

  1986. 		'node_attr_dim': 0,

  1987. 		'geometry': None,

  1988. 		'edge_attr_dim': 0,

  1989. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/MSRC_21C.zip',

  1990. 		'domain': 'computer vision',

  1991. 	},

  1992. 	

  1993. 	### social networks

  1994. 	'COLLAB': {

  1995. 		'database': 'tudataset',

  1996. 		'reference': '[14]',

  1997. 		'dataset_size': 5000,

  1998. 		'class_number': 3,

  1999. 		'task_type': 'classification',

  2000. 		'ave_node_num': 74.49,

  2001. 		'ave_edge_num': 2457.78,

  2002. 		'node_labeled': False,

  2003. 		'edge_labeled': False,

  2004. 		'node_attr_dim': 0,

  2005. 		'geometry': None,

  2006. 		'edge_attr_dim': 0,

  2007. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/COLLAB.zip',

  2008. 		'domain': 'social networks',

  2009. 	},

  2010. 	'dblp_ct1': {

  2011. 		'database': 'tudataset',

  2012. 		'reference': '[32]',

  2013. 		'dataset_size': 755,

  2014. 		'class_number': 2,

  2015. 		'task_type': 'classification',

  2016. 		'ave_node_num': 52.87,

  2017. 		'ave_edge_num': 320.09,

  2018. 		'node_labeled': False,

  2019. 		'edge_labeled': False,

  2020. 		'node_attr_dim': 0,

  2021. 		'geometry': None,

  2022. 		'edge_attr_dim': 'temporal',

  2023. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/dblp_ct1.zip',

  2024. 		'domain': 'social networks',

  2025. 	},

  2026. 	'dblp_ct2': {

  2027. 		'database': 'tudataset',

  2028. 		'reference': '[32]',

  2029. 		'dataset_size': 755,

  2030. 		'class_number': 2,

  2031. 		'task_type': 'classification',

  2032. 		'ave_node_num': 52.87,

  2033. 		'ave_edge_num': 320.09,

  2034. 		'node_labeled': False,

  2035. 		'edge_labeled': False,

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  2154. 	'IMDB-BINARY': {

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  2170. 	'IMDB-MULTI': {

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  2200. 		'domain': 'social networks',

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  2202. 	'infectious_ct2': {

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  2218. 	'mit_ct1': {

  2219. 		'database': 'tudataset',

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  2232. 		'domain': 'social networks',

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  2234. 	'mit_ct2': {

  2235. 		'database': 'tudataset',

  2236. 		'reference': '[32]',

  2237. 		'dataset_size': 97,

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  2239. 		'task_type': 'classification',

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  2245. 		'geometry': None,

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  2248. 		'domain': 'social networks',

  2249. 	},

  2250. 	'REDDIT-BINARY': {

  2251. 		'database': 'tudataset',

  2252. 		'reference': '[14]',

  2253. 		'dataset_size': 2000,

  2254. 		'class_number': 2,

  2255. 		'task_type': 'classification',

  2256. 		'ave_node_num': 429.63,

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  2261. 		'geometry': None,

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  2263. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/REDDIT-BINARY.zip',

  2264. 		'domain': 'social networks',

  2265. 	},

  2266. 	'REDDIT-MULTI-5K': {

  2267. 		'database': 'tudataset',

  2268. 		'reference': '[14]',

  2269. 		'dataset_size': 4999,

  2270. 		'class_number': 5,

  2271. 		'task_type': 'classification',

  2272. 		'ave_node_num': 508.52,

  2273. 		'ave_edge_num': 594.87,

  2274. 		'node_labeled': False,

  2275. 		'edge_labeled': False,

  2276. 		'node_attr_dim': 0,

  2277. 		'geometry': None,

  2278. 		'edge_attr_dim': 0,

  2279. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/REDDIT-MULTI-5K.zip',

  2280. 		'domain': 'social networks',

  2281. 	},

  2282. 	'REDDIT-MULTI-12K': {

  2283. 		'database': 'tudataset',

  2284. 		'reference': '[14]',

  2285. 		'dataset_size': 11929,

  2286. 		'class_number': 11,

  2287. 		'task_type': 'classification',

  2288. 		'ave_node_num': 391.41,

  2289. 		'ave_edge_num': 456.89,

  2290. 		'node_labeled': False,

  2291. 		'edge_labeled': False,

  2292. 		'node_attr_dim': 0,

  2293. 		'geometry': None,

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  2295. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/REDDIT-MULTI-12K.zip',

  2296. 		'domain': 'social networks',

  2297. 	},

  2298. 	'reddit_threads': {

  2299. 		'database': 'tudataset',

  2300. 		'reference': '[30]',

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  2302. 		'class_number': 2,

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  2304. 		'ave_node_num': 23.93,

  2305. 		'ave_edge_num': 24.99,

  2306. 		'node_labeled': False,

  2307. 		'edge_labeled': False,

  2308. 		'node_attr_dim': 0,

  2309. 		'geometry': None,

  2310. 		'edge_attr_dim': 0,

  2311. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/reddit_threads.zip',

  2312. 		'domain': 'social networks',

  2313. 	},

  2314. 	'tumblr_ct1': {

  2315. 		'database': 'tudataset',

  2316. 		'reference': '[32]',

  2317. 		'dataset_size': 373,

  2318. 		'class_number': 2,

  2319. 		'task_type': 'classification',

  2320. 		'ave_node_num': 53.11,

  2321. 		'ave_edge_num': 199.78,

  2322. 		'node_labeled': False,

  2323. 		'edge_labeled': False,

  2324. 		'node_attr_dim': 0,

  2325. 		'geometry': None,

  2326. 		'edge_attr_dim': 'temporal',

  2327. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/tumblr_ct1.zip',

  2328. 		'domain': 'social networks',

  2329. 	},

  2330. 	'tumblr_ct2': {

  2331. 		'database': 'tudataset',

  2332. 		'reference': '[32]',

  2333. 		'dataset_size': 373,

  2334. 		'class_number': 2,

  2335. 		'task_type': 'classification',

  2336. 		'ave_node_num': 53.11,

  2337. 		'ave_edge_num': 199.78,

  2338. 		'node_labeled': False,

  2339. 		'edge_labeled': False,

  2340. 		'node_attr_dim': 0,

  2341. 		'geometry': None,

  2342. 		'edge_attr_dim': 'temporal',

  2343. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/tumblr_ct2.zip',

  2344. 		'domain': 'social networks',

  2345. 	},

  2346. 	'twitch_egos': {

  2347. 		'database': 'tudataset',

  2348. 		'reference': '[30]',

  2349. 		'dataset_size': 127094,

  2350. 		'class_number': 2,

  2351. 		'task_type': 'classification',

  2352. 		'ave_node_num': 29.67,

  2353. 		'ave_edge_num': 86.59,

  2354. 		'node_labeled': False,

  2355. 		'edge_labeled': False,

  2356. 		'node_attr_dim': 0,

  2357. 		'geometry': None,

  2358. 		'edge_attr_dim': 0,

  2359. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/twitch_egos.zip',

  2360. 		'domain': 'social networks',

  2361. 	},

  2362. 	'TWITTER-Real-Graph-Partial': {

  2363. 		'database': 'tudataset',

  2364. 		'reference': '[26]',

  2365. 		'dataset_size': 144033,

  2366. 		'class_number': 2,

  2367. 		'task_type': 'classification',

  2368. 		'ave_node_num': 4.03,

  2369. 		'ave_edge_num': 4.98,

  2370. 		'node_labeled': True,

  2371. 		'edge_labeled': False,

  2372. 		'node_attr_dim': 0,

  2373. 		'geometry': None,

  2374. 		'edge_attr_dim': 1,

  2375. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/TWITTER-Real-Graph-Partial.zip',

  2376. 		'domain': 'social networks',

  2377. 	},

  2378. 	

  2379. 	### synthetic

  2380. 	'COLORS-3': {

  2381. 		'database': 'tudataset',

  2382. 		'reference': '[27]',

  2383. 		'dataset_size': 10500,

  2384. 		'class_number': 11,

  2385. 		'task_type': 'classification',

  2386. 		'ave_node_num': 61.31,

  2387. 		'ave_edge_num': 91.03,

  2388. 		'node_labeled': False,

  2389. 		'edge_labeled': False,

  2390. 		'node_attr_dim': 4,

  2391. 		'geometry': None,

  2392. 		'edge_attr_dim': 0,

  2393. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/COLORS-3.zip',

  2394. 		'domain': 'synthetic',

  2395. 	},

  2396. 	'SYNTHETIC': {

  2397. 		'database': 'tudataset',

  2398. 		'reference': '[3]',

  2399. 		'dataset_size': 300,

  2400. 		'class_number': 2,

  2401. 		'task_type': 'classification',

  2402. 		'ave_node_num': 100.0,

  2403. 		'ave_edge_num': 196.0,

  2404. 		'node_labeled': False,

  2405. 		'edge_labeled': False,

  2406. 		'node_attr_dim': 1,

  2407. 		'geometry': None,

  2408. 		'edge_attr_dim': 0,

  2409. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/SYNTHETIC.zip',

  2410. 		'domain': 'synthetic',

  2411. 	},

  2412. 	'SYNTHETICnew': {

  2413. 		'database': 'tudataset',

  2414. 		'reference': '[3,10]',

  2415. 		'dataset_size': 300,

  2416. 		'class_number': 2,

  2417. 		'task_type': 'classification',

  2418. 		'ave_node_num': 100.0,

  2419. 		'ave_edge_num': 196.25,

  2420. 		'node_labeled': False,

  2421. 		'edge_labeled': False,

  2422. 		'node_attr_dim': 1,

  2423. 		'geometry': None,

  2424. 		'edge_attr_dim': 0,

  2425. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/SYNTHETICnew.zip',

  2426. 		'domain': 'synthetic',

  2427. 	},

  2428. 	'Synthie': {

  2429. 		'database': 'tudataset',

  2430. 		'reference': '[21]',

  2431. 		'dataset_size': 400,

  2432. 		'class_number': 4,

  2433. 		'task_type': 'classification',

  2434. 		'ave_node_num': 95.0,

  2435. 		'ave_edge_num': 172.93,

  2436. 		'node_labeled': False,

  2437. 		'edge_labeled': False,

  2438. 		'node_attr_dim': 15,

  2439. 		'geometry': None,

  2440. 		'edge_attr_dim': 0,

  2441. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/Synthie.zip',

  2442. 		'domain': 'synthetic',

  2443. 	},

  2444. 	'TRIANGLES': {

  2445. 		'database': 'tudataset',

  2446. 		'reference': '[27]',

  2447. 		'dataset_size': 45000,

  2448. 		'class_number': 10,

  2449. 		'task_type': 'classification',

  2450. 		'ave_node_num': 20.85,

  2451. 		'ave_edge_num': 32.74,

  2452. 		'node_labeled': False,

  2453. 		'edge_labeled': False,

  2454. 		'node_attr_dim': 0,

  2455. 		'geometry': None,

  2456. 		'edge_attr_dim': 0,

  2457. 		'url': 'https://www.chrsmrrs.com/graphkerneldatasets/TRIANGLES.zip',

  2458. 		'domain': 'synthetic',

  2459. 	},

  2460. }

  2461. 

  2462. 

  2463. DATASET_META = {**GREYC_META, **IAM_META, **TUDataset_META}

  2464. 

  2465. 

  2466. def list_of_databases():

  2467. 	"""List names of all databases.

  2468. 

  2469. 	Returns

  2470. 	-------

  2471. 	list

  2472. 		The list of all databases.

  2473. 	"""

  2474. 	return [i for i in DATABASES]

  2475. 

  2476. 

  2477. def list_of_datasets():

  2478. 	"""List names of all datasets.

  2479. 

  2480. 	Returns

  2481. 	-------

  2482. 	list

  2483. 		The list of all datasets.

  2484. 	"""

  2485. 	return [i for i in DATASET_META]